課程資訊
課程名稱
表觀基因體學特論
Frontiers in Epigenomics 
開課學期
108-2 
授課對象
生物資源暨農學院  生物科技研究所  
授課教師
林劭品 
課號
Biot7014 
課程識別碼
642EM0150 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期五6,7(13:20~15:10) 
上課地點
生技所415 
備註
本課程以英語授課。
限碩士班以上
總人數上限:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1082Biot7014_Epigen 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

1.選讀 Epigenomics 相關領域最新發表文獻與近期研討會討論議題。包含DNA甲基化、染色質調控、功能性 non-coding RNA對於細胞生理與病理之影響。
2.將不定期邀請國內外專家學者演講、共同研討。
We will select the most updated literature with significant breakthroughs in different layers of epigenomic regulatory machineries. These includes the studies on how DNA methylation, chromatin modification and remodeling, functional non-coding RNA machineries that coordinately regulate epigenetic landscape and this gene expression pattern and cell fate. We will also discuss wet bench experimental design and bioinformatic analytical tools for analyzing and consolidating DNA methylome, transcriptome, small RNA analysis, lincRNA and native elongating RNA-seq and Chromatin-ImmunoPrecipitation (ChIP)-seq, ChIRP (Chromatin Isolation by RNA purification) and RNA-IP-seq datasets. Contents of most recent international conferences, sometimes including unpublished data, will also be discussed.
We will also periodically invite local and international experts to join our course. One week before their seminar, we will discuss their published research article to help students prepared for the actual interaction with world experts in the field. 

課程目標
本課程主要為協助研究生研習表觀基因體學的最新研究成果,包含國內外研討會中與會專家、演講者之尚未發表研究內容,並經由英文報告與討論的過程中建立與專家互動之自信。 
課程要求
已修習相關後生遺傳學、後生遺傳調控機制新知、配子與幹細胞之上位遺傳學、細胞在程序化、功能性Non-Coding RNA新知、Epigenomics等任一學科 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
待補 
參考書目
最新期刊、研討會內容解析


20160226 授課教室改為生技所 R212。 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
3/06  Epigenome Introduction Pre-Course info 
第4週
3/27  Progress report (Yuka): https://youtu.be/v9vcYHNbgNQ 
第6週
4/10  Nutrition and Epigenetics (Gibson): https://youtu.be/dpUsvKFAvws
Biomarkers for Neurodegeneration Diseases (Ping/Dr. Tsai)
 
第7週
4/17  PIWI-piRNA pathway in chicken PGCs (Denis): https://youtu.be/XAWTuwO7X0o
From diagnosis to therapy: Tackling cognition disability in Parkinson's Disease Patients (Proposal Preview; Ping, Dr. Tsai, Yan-Ru; Yuka; Dr. Kuo) 
第8週
4/24  Ph. D. presenting (Gibson): https://youtu.be/oWIdGg3d8a0 
第11週
5/15  Dr. Tsai: https://youtu.be/P5TYOvYAs84
Dr. Guo: https://youtu.be/LmuejODx3RA 
第12週
5/22  https://youtu.be/PzIvAU3lAHE
(Extra class: 5/20 "You are what your grandmother ate: a warm up session for Prof. Diana Laird's upcoming talk on 6/17" 
第13週
5/29  彥如Final Progress report: https://youtu.be/Q2NjSdreF_8
 
第14週
6/05  Yuka progress report: https://youtu.be/ZxxV6xI9kVg 
第15週
6/12  403 Lab meeting: https://youtu.be/vortkn6B-5A